El Club Natación Nassica fue creado en 1999 por padres de alumnos de la escuela de natación C.D.M. La Planilla con el ánimo de querer impulsar la natación de competición en la ciudad de Calahorra. Juana Quero fue nombrada primera presidenta de la entidad , siendo José Luis Rioja primer entrenador del club. La primera pueba en la que participaron fue en 1999 en la Travesía a la Laguna Negra (Soria) con la participación de Felipe Hernández que obtuvo la primera medalla para el club. En piscina debutaron en Noviembre del mismo año en la Liga Benjamín y Alevín de esa temporada celebrada en Arnedo. En esa liga destacaron las medallas de oro de Angela Oca en 100 metros braza . Se convirtió en el año 2000 en la primera en acudir a un Campeonta de España seleccionada por la Federación Riojana de Natación..
- Primeros Grandes logros
En el año 2001 con 11 años la nadadora Sandra Calahorrano fue seleccionada para un programa de de seguimiento de jovenes talentos por parte de la Real Federación Española de Natación. Acudió junto con otro nadador riojano como únicos riojanos seleccionados para ir a este campus.
El 14 de febrero del año 2002 a esta misma nadadora el Ayuntamiento de Calahorra otorgó el “Premio a la mejor deportista Ciudad de Calahorra” dotado con una beca deportiva de 600 euros
Un año después se produjo una renovación en la junta directiva del club siendo nombrado presidente José Luis García Sanz como nuevo presidente. El mismo año dos nadadores del club consiguieron acudir al Campeonato de España a nivel individual. Fueron María Marrodan y Jorge Mancebón. De nuevo en el año 2005 se renovó la junta directiva nombrando a Pedro Pació Legaspi como nuevo presidente. Ese mismo año el club fue galardonado con tres premios y distinciones “Ciudad de Calahorra” , al mejor deportista promesa, Alberto Miranda, al mejor técnico, José Luis Rioja y al mejor club. Y en el año 2006 el Club Natación Nassica se proclamó campeón y mejor club riojano en los Campeonatos de La Rioja de Verano e Invierno recibiendo galardones, Alberto Miranda y el club
- Segunda mitad de la primera década
A mitad del año 2006 hubo un relevo técnico, siendo nombrada entrenadora del club Mercedes Rey Urdaniz.
Desde el punto de vista deportivo el club siguió cosechando grandes éxitos. Alberto Miranda consiguió varias mínimas para acudir a los Campeonatos de España de Natación tanto en el año 2006 como en el año 2007. En el año 2008 el club recibió en la Gala del Deporte el premio al segundo club mas medallero. Durante esa temporada y las siguientes varios nadadores del club consiguieron mínimas para acudir a los Campeonatos de España de Natación y en categorías mas jovenes el club consiguió situar a alguno de ellos entre los primeros del Ranking Español y batiendo varios records de La Rioja.
La presidenta del club desde el año 2014 fue Mª Carmen Matute. Durante la temporada 2013/2014 el club se encontró compitiendo al mas alto nivel contando con varios nadadores participando en el Campeonato de España por Comunidades Autónomas. El club superó las espectativas en el III Torneo Ciudad de Calahorra y logró grandes resultados en otros Torneos y Campeonatos.
Desde el año 2010 el club ya no solo está formado por nadadores riojanos, sino que también cuenta con navarros. Varios de ellos han sido seleccionados por la federación y han conseguido mínimas para representar al club en los Campeonatos de España.
En la temporada 2014/2015 el club mantuvo el mismo nivel. Bastantes nadadores ocupan los primeros puestos en los Juegos Deportivos de La Rioja y acuden a torneos en Logroño y Zaragoza logrando buenos resultados.
En septiembre del año 2015 el club realiza un nuevo cambio técnico nombrando entrenador a Roy Colson, licenciado en INEF. Una persona que respira aguan, lleva cloro y una marcada trayectoria marcada por la profesionalidad, con muy buena formación y una extraordinaria experiencia cualificada.
Sus comienzos fueron inmejorables y el club pudo contar con 3 de los nadadores en la selección riojana infantil – junior que participó en el Campeonato de España por Comunidades Autónomas. En marzo de esa temporada otros tres nadadores alevines del club fueron seleccionados por la federación para defender los colores de La Rioja en el Campeonato Nacional del Consejo Superior de Deportes.
En julio del año 2016, Laura Vitoriaca(nadadora de Sartaguda) consiguió mínima para participar en el IV Campeonato de España Alevín celebrado en Madrid. En el participaron los mejores nadadores españoles, destacando nombres como Paula Juste o Claudia Espinosa, medallistas nacionales.
La siguiente temporada comenzó al mismo nivel que finalizó la anterior. En los Juegos Deportivos de La Rioja ocupamos los primeros puestos en muchas pruebas . Hemos participado en torneos de dos clubes amigos consiguiendo varios pódiums en las diferentes categorías.
En cuanto a las selecciones de La rioja, en la de los mayores tuvimos una representante Lucía Abad y en la de alevines , de 16 nadadores seleccionados, 5 de ellos son de nuestro club: Carmen Navarro, Oihane Arana, Miguel Ruiz, Eduardo Medel y Luca Guaramia.
En el mes de octubre del año 2018 hubo un cambio en la junta directiva siendo nombrado presidente, Ángel Martínez.