La historia del fútbol riojano ha ido ligada, en algunos casos, al País Vasco y a Navarra, con las que han compartido competiciones a lo largo de la historia.
Algunos de los equipos de La Rioja han estado adscritos a la Federación Guipuzcoana de Fútbol. Estos son los que lo han estado en algún momento:
Logroño Recreativo Club, Deportivo Logroñés, Haro Deportivo, Deportivo Maestranza Aérea, Recreación Logroñés, Deportivo Calahorra, Logroño Rayo E. y D., H.S.Labradores de Alfaro, C.A.Escuela de Comercio, Deportivo Jalisco,...
