La historia del fútbol riojano ha ido ligada, en algunos casos, al País Vasco y a Navarra, con las que han compartido competiciones a lo largo de la historia.
Algunos de los equipos de La Rioja han estado adscritos a la Federación Guipuzcoana de Fútbol. Estos son los que lo han estado en algún momento:
Logroño Recreativo Club, Deportivo Logroñés, Haro Deportivo, Deportivo Maestranza Aérea, Recreación Logroñés, Deportivo Calahorra, Logroño Rayo E. y D., H.S.Labradores de Alfaro, C.A.Escuela de Comercio, Deportivo Jalisco, Atlético Riojano, Deportivo Loreto, Náxara E. y D., Atlético Riojano Jalisco, Centro de Deportes Aldeano, Burle P.A., Deportivo Tardío, Deportivo Berceo, Deportivo La Calzada, Deportivo Náxara, Deportivo Arnedo, Junior C.F., Deportivo Aldeano, Deportivo Alfaro, Deportivo Juvenil (Calahorra), Deportivo River, Rincón de Soto, Deportivo San Lorenzo, Ezcaray, Deportivo Riojalteño, Haro y Peña Balsamaiso.
No son muchos los equipos que formaban parte de la Federación Riojana en su creación. Estas eran las competiciones:
Primera Regional: Náxara, Logroñés Pr, San Marcial, La Calzada, Oyonesa, Calahorra Pr, Ence, Balsamaiso, La Unión, Autol, San Lorenzo, Loyola, Valvanera, Bañuelos, Atlético Riojano, Vianés, San Mateo y Albelda.
Segunda Regional: Casco Viejo, Lapuebla, Cenicero, Agoncillo, Cantabria, El Cortijo, Pradejón, Varea, Entelena, Quel y Torrecilla.
